三体人の技術レベルについての納得感は個人差があるとしか言えないわ。
陽子を二次元展開し回路をエッチングし、強い相互作用で結合された物質を作り、対消滅エンジンで航行する宇宙艦隊を作れる。
それぞれの技術について「〇〇もできるんじゃないの?」と考えるのも正当だけど、個人的には智子が思考を読めないと言われても普通に納得したかね。

現実の科学での脳の理解は、非ノイマン型で膨大なニューロンとシナプスからなる超並列コンピュータで、
思考といっても意識と無意識が混濁し、同時並行して様々な活動を行っている器官、ぐらいな認識だが。
紙資料、コンピュータのデータ、音声などは完璧に理屈が理解されてるけど、脳はまだまだブラックボックスだからSF的に自由に解釈してるんでしょう。