すみません、一応問題が解決(?)しましたのでご報告。


結論から言うと、アプリケーションのデータ仕様をロケールに影響されない内容に
変更することにしました。

具体例としては、以下のような感じです。
・CSVファイルの中の実数値(例:123.4)
→1000倍した整数値に変更。(例:123400)


今回は、私にデータ仕様の決定権があった点、データの精度や
処理効率から見ても問題ない点などからこのような
判断になりました。


知恵を貸していただいた皆様、どうもお世話になりました。