SMLとのコンパチを取るライブラリなんていう後向きの物は聞いたことありません。
OCaml の stdlib は「標準ライブラリ」にあらず、 OCaml 自身をコンパイル
するために最低限必要な関数を集めただけと考えたほうが幸せです。
「次世代」標準ライブラリ候補として Extlib, OCaml Batteries Included, Jane Street Core
などありますからそれのウチ好きなのを使ってください。(Batteries は Extlib を内包しているはず)

ビルドは make か OCaml 付属の ocamlbuild か omake か、別に何でも良いんじゃない？
- GNU make : どこにでもある。他でも使える。枯れてる。
- ocamlbuild : OCaml に付属。全く使えない。
- omake : 超強力、普通インストールされていない。強力過ぎて一線を超えた使いかたが難しい。