りファクタリングって言うのは、オブジェクト指向の言語（これが大前提）で、
開発段階にあって、試作品が第一段階で問題なく動いて、
あとは性能やコードの見直しやｶｲｾﾞﾝだよねって段階で設計へフィードバックするプロセスですよ。
その後に顧客側のチェックと納品ですよね。

運用中のシステムに手を入れるという話では無いですよ。
ｶｲｾﾞﾝを全否定ならトヨタはどうなるんでしょうか？