リアルモードはほぼ16bit推奨環境
プリフィックス付かどうかで動作変わる命令は操作対象が16bitであると解釈される
例) INC AX → 40、INC EAX → 66 40
付く分動作が遅くなる、つまり、リアルモードで32bit操作は期待するほど速度でない

プロテクトモードは32bit環境
例)INC AX → 66 40、INC EAX → 40
操作対象が16bit幅な命令も使えるけどリアルモードより遅い

x64もレガシーモードで動作させればリアルモードを使えるけど、使える命令はx86命令に限定される、ハズ
なのでいいんですか?と聞かれたら概ねいいですと答えていいんじゃないですかね