GNU Smalltalkを使ってるとき
ObjectMemory snapshotで保存したClassを
削除できなかった件自己解決しました。

ClassだけじゃなくMetaClassの削除と
Namespaceからの削除が必要らしい。

Classを削除する手続の例:
! ClassManager methodsFor: ''!
deleteClass: aClass
　| superClass nameSpace |

　superClass := aClass superclass.
　nameSpace := aClass environment.

　nameSpace removeKey: aClass name.
　superClass removeSubclass: aClass.
　superClass class removeSubclass: aClass class.
!!