>>272
もう答えが出てるも同然なんだけど、親切ぶって書いておくと

＞コンフリクトの解決でなにか必要なオプションがあるのですか？

コンフリクトの解決として、ローカルにあるファイルを生かすのか、削除するのかは
ユーザーが選ぶ必要がある。

その選択がすでに決まっている(今回の場合はリポジトリ優先)なら update / resolve のオプションで
--accept theirs-conflict か theirs-full が使えるかもしれない。