俺はIDBTransaction.oncomplete内でdb.close()していたのだが、
以下ではIDBRequest.onsuccess内でやっており、
//nparashuram.com/IndexedDB/perf/#Transaction based on Write
それってありか？ということでMDNを確認した結果、MDNでもそうなので
https://developer.mozilla.org/ja/docs/Web/API/IDBDatabase/close
パッチして味見した結果、とりあえず倍くらいにはなった。

それでもまだ遅いが、今は安定して動く状態ではないので詳細は確認出来ない。
本修正して安定動作させ、まだ遅いようならもう一度投稿する。
ちなみにコード自体は上記上側と似たようなもの。ただしoncompleteを使っていた。