アドバイスありがとうございます。ソースのdialogはonClickの引数と同名でしたが実際は別名で、ここではdialog1とします。また、dismiss()は動作していたようでダイアログが消えて数秒経つとANRが出ます。アドバイス戴いたようにdismiss()をハンドラーにしましたが同じ結果です。
button.setOnClickListener(new View.OnClickListener() {
@Override
public void onClick(View v) {
new　AlertDialog.Builder(getActivity())
.setTitle("Test1")
.setMessage("test1")
.setPositiveButton("OK", new DialogInterface.OnClickListener() {
@Override
public void onClick(DialogInterface dialog, int which) {
dialog1 = new AlertDialog.Builder(getActivity())
.setTitle("Test2")
.setMessage("test2")
.show();
new Thread(() -> {
try {
Thread.sleep(5000);
} catch (Exception e) {
} finally {
handler1.post(new Runnable() {
@Override
public void run() {
dialog1.dismiss();
}
});
}
}).start();
}
})
.show();
}
});