ディレクトリ構造の場合は必ずルート以外は親いるから、まさしくツリーになるけど。

メールやツイートの場合は返信と関係ない独立したメールのインスタンスが存在するから、返信関係はツリーであるとは言わん。

もちろん、実際返信関係が成り立っってるミクロな部分だけ見ればツリーだけど。