>>356
たぶん原因が分かりました。
現在は標準関数をやめてWINAPIのCreateThreadを使ってますが標準関数と原因は同じです。
CreateThreadでThread1,Thread2を作成して監視してるとあるタイミングでThread2が消失してたのですが
どうやらThread1で変更があった他のグローバル変数の値がThread2で上手く読めずに終了判定されて消えてたようです。
ようするに他のグローバル変数の書き換えが原因でした。
ロック処理をしたりしたのですが上手く行かずグローバル変数すべてにvolatileをつけると上手く動いてるようです。
でもこの回避作で良いんでしょうか？CriticalSectionを使ったりして処理してもうまく他スレッドでグローバル変数が
参照出来なかったのでvolatileをつけてみたら完璧に動作するようにはなったんですが……