↑の補記
話を具体的にするために言い換えますと、
仮にファイルAはウェブサイト側のjs、ファイルBはブラウザアドオンのjsだとします
ブラウザアドオン側のjsの作者は、ウェブサイト側のjsで作って使っている関数名を全て調べて知っておく（そして衝突を避ける）
なんてことをするのは現実的ではないと思うのですが
どうやって衝突を避けるのでしょう？　という疑問なのです
ファイルAのjs内で呼び合っている関数ならスコープで保護されるのは分かるのですが
HTML（DOM)のonclick等に書いてしまった場合スコープ情報が抜け落ちるような気がするのです

細かい話ですが、要素のaddEventListenerに登録する場合も、そのまま関数名だけならスコープ情報を登録してくれそうな気がしますが
関数に引数を渡したくてaddEventListener("click","function(){hoge(a,b,c)}",false)のように登録してしまった場合はやはりスコープ情報が抜け落ちそうな気がするのですが
そんなことはないのでしょうか？