最近のアプリの設定ファイルの格納場所としては
%USERPROFILE%\AppData\Local\Packages\
以下にある程度まとまってはいる
ただし一般ユーザが内容を修正することはほぼ不可能

ちなみに設定ファイル以外だと
インストールモジュールがC:\Program Files\WindowsApps\
レポジトリがC:\ProgramData\Microsoft\Windows\AppRepository\

相互に情報共有しているので勝手に改変するのは極めて危険