http://www.atmarkit.co.jp/fdotnet/special/mono10_01/mono10_01_04.html
＞「え！ Linuxなのに拡張子が“.exe”なの！」と思う読者もいると思うが、そのとおりである。

.exeは”MS系OSの実行可能ファイル拡張子”で、クロスプラットフォームな拡張子じゃない。
まずこの時点で自社製品優遇の仕様が入れられてる。