元のシステムを作っていた方が亡くなって、自分がシステムの改良を引き継ぐことになったのですが、
仕様書が数年前から更新されておらず、どう見ても仕様書と実装が一致していません。

それを上に報告したところ、実装に合わせて仕様書を書き直せと言われたのですが、いい方法はないでしょうか？
ソースコード全体で380万行くらいあり、DBアクセス処理もあちこちにあり、テーブル構造がちょっと変わると大規模改修が必要になるんじゃないかと思っています。

1000近いユーザーの3万台以上の端末で動いているシステムで、もう触るのも怖いです・・・。