話が見えないなあ
数字ってのは座標？
別窓ってのはまさかサブディスプレイ？

adbというかAndroid内で座標なんかズレやしないんだから外側からの与え方、取得の仕方に問題があるだろう
ウインドウ指定で取らずデスクトップ基準で取ってるのでは？

何言ってるのかわからんレベルならスクリプト貼ってくれた方が話しがはやい