おまえ要領を得ないって良く言われるだろ
何を最小化したいの？コンソール画面？バッチから起動したアプリ？
アプリ起動にバッチを介するようになって困っているようだけど
コンソールはすぐ消えるから大して困らんでしょ
その一瞬も困るってこと？
コンソールならバッチへのショートカットのプロパティに[実行時の大きさ]
アプリならstart /min
そのバッチを貼れない理由でもあるの？