dir /ad /b /s > tmp.txt とかで処理対象のディレクトリ名をテキストに落としてから
wshでリネーム用のバッチファイルを作る方が楽かな

wshではテキストを一括読みして変数に入れて
テキストを順次読みしながら↑の変数の内容をバッチファイルのコマンドに変更してく
下位ディレクトリや同一フォルダ名になるときの判定などもしやすい
もし失敗しても、原因を見つけやすいしリカバリーもしやすい