ファイルに対する操作が追記なのか、それともランダムアクセスによる更新なのか
ファイルのサイズがどの位なのか、
処理1と処理2は独立した内容なのか、それとも順序性があり、処理1が完了する前提が必要なのか
などなど色々条件がありそうだけど、
乱暴に言ってしまうけど、ファイル操作なんて大して重たい処理ではないと思う