>>135
ApplicationSettingsBaseなんて使ったことないのでいい加減に言うけど、
普通に考えれば保存場所は起動したバイナリのパスになんか依存しないはずだと思うけど

http://www.atmarkit.co.jp/fdotnet/dotnettips/438winsettings/winsettings.html
ここにも書いてあるけど、バージョンとか製品名とかアセンブリの属性を何か変更したから
保存場所も変わったんじゃないの？