msixにするとアプリによっては動かなくなるから気をつけて
行儀のいいアプリなら問題ないと思うけど

dotnet publishの出力先をコピーしてexeのショートカット作るだけのインストーラーが何かで作れるなら、そっちのほうが問題はおきにくい