というか「WindowsのShift-JISへの対策・対応状況」と
「Linux (Unix) のShift-JISへの対策・対応状況」とでさして違いがない。

「LinuxでShift-JISに対応しようとすると多数のソフトの修正が必要」というのであれば
同じ問題がWindowsでも起きてる。
実際ダメ文字っていう概念はLinuxに限った概念じゃないからね。
むしろWindowsでShift-JISに対応しておらずダメ文字が問題になった例の方が、
人口比的なものもあるだろうけど、より有名じゃない？