え?普通$PWDの方を使うでしょ
pwdにメリットなんてあるの?
デメリットならいくつか言える

外部コマンドなので遅い
ほどんどの場合、結局変数に入れて使う
変数に入れる時に標準出力経由でやるから更に遅い
変数展開が使えないから、/foo/bar/baz からbazだけを取るのが面倒で遅い
(まずありえないけど)改行で終わるディレクトリが正しく取れない(工夫すれば取れるけど)

唯一のメリットはPWDの内容と実際のカレントディレクトリが違う場合が
あることだけど、PWDはシェルスクリプト起動時に初期化されるので
意図的に変更しないとそうはならない。どうしてもPWDを
カレントディレクトリに初期化したいなら cd . でも実行すればいい

> C言語やPythonでも$PWDは参照できる。
それはPWDが環境変数としてエクスポートされてる場合でしょ?
unset PWDしてから起動しても参照できるって保証はあるの?