どうも>>47です。色々なアドバイスありがとうございます! レス一つ一つの引用は割愛
させていただきますが、アドバイスを元に試してみます。

あ、JSONのようなと書きましたがJSONです。
辞書の可読性というのは、例えばほぼ碁盤目状に並んだ住宅配置みたいのがあって、
{ "山田邸": {x=,y=, ...}, "鈴木邸": {x=,y=, ...}, ...} みたいのが配置の順序で（キーボード配列
で言ったら q,w,e,r,...., a,s,d,f, .... 等）並んでいる状態のことです。
元の可読性を維持するには〇〇邸でソートして欲しくなく、やるならyでソートして次にxで
ソートするみたいな... しかしふと、この場合はそもそも配列のほうがよかったのかも。
まあとにかく、キー順縛りでいけるのかな?

あと、差分を表示するのも標準的なdiff、差分付近の表示でなく、例えばLinux上ならmeldの
ようなものを使いたく... と思ったら json-diff には -f (full) というオプションが。