思いつきだけど
[合計文字数][26]の2次元配列を作る
各文字ごとに均等に配置
空白部分には空白なりNoneなり入れる
2次元配列を縦方向に連結して1次元配列にする
空白を除去する
ってのはどう？

aaabbc
[a,n,a,n,a,n]
[b,n,n,b,n,n]
[c,n,n,n,n,n]
abcaba