>>339
SELECT句の中にアスタリスク使ってない？
UNION句で挙動がおかしくなるのはCSVファイルじゃなくてEXCELのシートにSQL投げたときに起こるのも見たことあるけど
まぁそもそもDBに投げてる訳じゃないからある程度は仕方ないってところもあるよ。

CSVファイルはUTF-8かSJISかってのもあるけど
UNION句の上下入れ替えたら直ったというのであれば今回は関係なさそうだしね。