俺が例にするとしたら「実験ノート」と「科学論文」かな。
長文君とかが欲しがってるのは「実験ノート」を録るツール。
git とかが提供しているのは「科学論文」を共有する論文誌。

「実験ノート」はありのまま全ての情報を記録するのが目的で後から修正したりしたら改竄になる。

でも「実験ノート」をそのまま貼り付けただけでは「科学論文」にはならない。論文では必要な情報だけを抜き出し簡潔にまとめて他人に分かり易く説明する必要がある。
そのためには何度も推敲する必要があり、手元にある論文の原稿は何度修正しても良い。改竄とかじゃない。

あと一度出版された論文の内容は修正できない。訂正するには新しい論文を書いて指摘する必要があるあたりも同じ。

意外と長文になった。すまん