そもそも正規化自体は都合に合わせて勝手にやるもんだぜ？
Windowsの.で終わるファイル名を拡張子なしと同一視するのも正規化だし
掲示板への書き込みで行頭のスペースが消えるのも正規化だ
Unicodeで定義されたやつだけが正規化ではないというのは大前提として

字形を変えない範囲で厄介な合成分解で別ファイル扱いになるのを避けたい
というのは他の文字コードからUnicodeへの過渡期では当然の要求だろう
他のOSとのやりとりでトラブルが起きるようになったのはもっと考えるべきだったとは思うが