別にMSじゃなくても伝統的な日本語（JIS系や adobe-japan系）の文字しか入ってないフォントで重複してることなんてめったにないよ
複数の国の文字（中国漢字など）や異なる用途の文字（部首素片など）を同じフォントに収録してる場合にグリフ重複させる場合が多い
最近 google の Noto フォントみたいな多言語対応フォントを使い始めるやつが増えて問題を「再発見」してるだけ
そのせいで unicode のせいだとか言い出すアホが湧いてたわけだが（当然だがフォントには unicode に関係なく任意の文字とマップが登録できる）