プレゼン用のきれいな図も描けるのは
やっぱり GMT かなと思うのですが，
実験データを解析しながらあれこれとプロットするときは
GMT も gnuplot も操作が面倒です．
KaleidaGraph や Origin のようなインターフェースの
GMT のフロントエンドってないでしょうか？