autoconfは便利だしとっつきやすいが、
automakeまで手を伸ばすのはちと面倒なんだよな。

どうせ最初から使う必要なんてないんだから、
必要を感じてきたらそのとき導入すればいいよ。

>> prepare_projectなるスクリプト
MS的にいうとautotools_wizardだね