ぐぐったら入力途中で候補にautoconf with vs enableというのが出てきたので
その結果を見てみたらいろいろと議論はあるようだ。

https://mail.python.org/pipermail/python-dev/2001-January/011991.html
ここの解説だと、機能の有無を決めるのにenable、依存するパッケージとかの
指定にwithを使うという感じみたい。それでも例外もあるようだ。