>>534
とりあえず、メッセージボックスからダイアログへ変更してみた。
変更したパスは teraterm.ini のエントリに残すようにはしたが、
いちいち Save setup しないといけないのがいまひとつ。

teraterm.ini の内容が変わっていたら、Tera Term終了時に自動セーブ
するか、警告を出すようにしてみるのはどうだろうか？