>>321
> やりたいことは、すでにある window を並べて表示する。
これは join-pane でおk
だけど、これは 「window を並べる」というより、window を2つの pane に分割して、そこに別の window を pane として並べるという感じ (man tmuxより)
おそらくこの時点で window 番号は失われてる

> で、もうひとつ条件としてその時に、window ナンバーが崩れないようにしたい。
なので、join-pane した window を、再びバラバラに (break-pane) すると、window 番号が変わる可能性がある (空いている最小 window 番号が割り振られる)

tmux 内で、任意のシェルコマンドが実行できるので、
join-pane で window 番号を保存
break-pane で 保存してあった window 番号に復元する
みたいな設定をすれば目的は達成できそうな気がする