なんでだろうね。
tmuxのソースコードをgrepしてみるとCで書かれたソースコード中、mkdirを呼んでるのは
ソケットをおくためのtmux-$UID ディレクトリを$TMPDIRなどに作る一箇所だけだった。

実はtmuxでなく、シェルが読み込むファイル中である条件の時だけ作ってしまっていた……なんて話はない？