plink使ったこと無いから適当いってみるけど、
plink自体にSJISでコマンドラインオプションが渡ってるっぽい？
ので、変換するようplinkを改造するか、
いっぺん実行したいコマンドをファイルに(unicode?)で書いて、
plink -m で実行するかかな？