>>254
LaTeX初心者であれば情報量の少ないAtomでLaTeXってのは避けたほうがいい

試しにAtomでptex2pdf -u -lと設定してちゃんとjsarticle文書をコンパイルできたから
Atomの設定の問題だと思うよ
ただし，Atom初心者だからアドヴァイスをしてくれと言われても困る