それについてだけ言えばとりあえずはsymlink張って誤魔化せるとは思うけど、
avidemux*以外のものまで古いports treeでビルドするのは
不整合が入り乱れて手を付けられなくなるんじゃないの。
特にqt関係のもの同士で新旧のが入り交じると。

avidemux*以外の必要なものはすべて現行のports treeからインストールした状態にしてから
古いports treeからavidemux*だけインストールを試みないと、
お望みの状態には持っていきづらいのでは。