とりあえず検証のためにsttermを入れて試してみたら問題ありませんでした。
xfce4-terminalの問題のようですが、
別のKona 3.0(Debian 8)の環境はxfce4-terminal 8.4で、
現在のMX-18.3(Debian 9)とxfce4-termnal 8.3/8.8と何が違うのかはわかりません。