最新版をDLしたとあるので問題は無いと思いますが、一応最新版は
・ティラノスクリプトVer475c
・ティラノライダーV220 for Windows
です。
Win10更新したうちの環境でも最新Verは今のところ音の不具合は
ありませんので520さんの環境だけなのかも？

Midiソフトとか使うとソフト音源とか変わったりしてYoutubeとか
鳴らなくなったりするのですがティラノだけですと違いますね。

ティラノビルダーも同じ感じですか？

公式の掲示板（ティラノスクリプトの方）に不具合報告スレが
あるので、一応書き込んでみてはいかがでしょうか。
（回答とか全く無いですが、制作者か、原因わかる人が見る可能性が
ありますので）