Instantiateなんてもんがわざわざあのになんでインスタンスにこだわるん？
プログラミングの知識あるならシーンに設置したオブジェクトがインスタンスって方がわかりやすいぞ

シーン内に個別に設置（インスタンス）したオブジェクトの値を変更してもプレハブ（クラス）には影響がないが
プレハブ（クラス）の値を変更したら個別に設置（インスタンス）したものにも影響がある
インスタンスからクラスに無理やり影響を与えるのがApply