とりあえず消したいウインドウ内の表示を行っているプログラムの記述を
左上のウインドウ(TopWindow)内の表示を行う部分から左下(BottomWindow)内の表示を行う部分に
内容全部そのままで移動させたらちゃんと２枚目表示時に消えるようになったな。
左下の表示だけ何で消えるのか突き止めれば何でこうなるのか分かるわけか