後ろにしたいスプライトをSPLAYERで下のレイヤーに振ればいけるはず。

BGについては、画面に敷き詰めるような場合に描画周りとか考えなくてもいいので
そういう意味もあって置いてるのもあるんじゃないかな。
あとはプチコン４のPCG的な仕様だと、テキスト周りの命令だけでグラフィカルな画面作れるのもあるかも。
（現状サブプログラム使わないと入力面倒だけど）