アプデ時にSteamの方で最新アセットのデータだけダウンロードして他のゲームと同じようにSteamappフォルダに保存
Steam版Uniteの起動時にSteamの方のデータ引っ張ってきて最新版を適用とか?
これだと毎回Steamも立ち上げつ必要あるから普通にUnityのアセットマネージャーからアプデした方が楽そうだけど