フィリピンと中国内陸部から圧力を掛ければ、
最悪でも空襲で空港と港湾を破壊してその後は定期的に様子を見てれば無力化出来るからな。

日本進攻のための前線直下の兵站拠点としては、ほぼ等距離の位置にフィリピンとマリアナがあるから価値も高くない。
全島制圧に掛かるコストとリターンを考えるなら、無理して手に入れなくても良いって判断したんだろ。

台湾の航空戦力が引き抜かれて弱体化してるのは偵察と諜報で把握してただろうし。