旧世界が人類の再生に全振りしてたなら、万が一を考えて墓所に相当する施設は複数、それも世界各地に設置されてると思うのだがなあ。
何らかの事故とか隕石の衝突や地殻変動なんかで破壊されちゃう可能性はあるんだし。

だからあそこの施設が吹っ飛んでも他の施設で目的は完遂されるんじゃね? 
とりあえず真っ先に浄化される予定の地域に1つおいときゃそこから安全に再建開始できるんだし。