H&KのG3やMP5などはコッキングハンドルが左にあるのですが、
どういった目的なんでしょうか。

個人的にはジャムの際などで強制排莢する際に力が入りやすい右側にあるほうが自然だと思いますし、
現に右側になる銃のほうが多いですよね?