ミッドウェー敗因の原因として盛んに言われる「不明瞭な作戦目的」の原因は、
作戦に疑義を呈する軍令部ほかを説得するために山本GF司令部が二枚舌を使ったことが原因であろうと推測しますね

GFはミッドウェーをつついて敵艦隊の誘出撃滅をやりたいが、ただそれだけでは不幸にして会敵できなかった場合には
どうするのかと確実に指摘を受ける
確かに貴重な内地の決戦用備蓄燃料に手を付ける以上、何の成果も無しでは許されない
で、苦し紛れに思いついたのがアッツ、キスカ、ミッドウェー占領による本土哨戒線の前進策だったと
それが体裁に過ぎないことは、占領後の維持が困難なことを訴えた近藤に対して「無理なら施設を破壊して撤退する」と
言い放った宇垣の発言から明らか

そういった組織内外の事情により、山本GFは外に対しては(心にもない)ミッドウェー〜アリューシャン占領の意義を説き、
部下や身内に対しては敵艦隊の撃滅が目的であると説く羽目になり、本音と建て前が錯綜して誤解(?)と混乱を生んだのだと思う