・財務省　→　会計省に改組し、予算編成権は内閣府に移管。
・国税庁　→　内閣府の外局の歳入庁に改組。財務省主税局と統合。
・文科省　→　文化省に改組。文化省は文化庁＋旧科技庁。教育関連は内閣府教育局と、高等教育局に移管。
・総務省　→　自治省に改組。電波通信行政は、内閣府の外局の通信庁に改組。
・厚生労働省　→　厚生省と労働省に再改組。
・環境省　→　気象庁を環境省に移管　
・保安省　→　機動隊と海上保安庁を統合し保安隊（機動保安隊、沿岸保安隊）を編成。
　　　　　　　　　また、広域警察組織である保安警察本部を設置。保安隊も保安警察も身分は「保安官」
・国家公安委員会・警察庁　→　全国警察本部連絡協議会に改組。警察キャリア制度は廃止