土塁や掩蓋は無意味という流れになっちゃってるけども、そうでも無いと思うよ。
まず、ミサイルで空軍基地を無力化しようとした場合、滑走路をクラスター弾で狙うのが基本。
3000m滑走路でも、2箇所×2発で、ジェット機の発着がほぼ不可能になるので効率が良いからだ。
必要なのは、その際にクラスター弾により発生する火炎を含んだ爆風や、飛散する破片から機体を守ることで、土塁はそれなりに効果がある。

そもそも論としては、基本的に移動できない司令部機能や弾薬庫、燃料タンク、電力施設などを分散化するか、地下化するなどして防護するのが優先する。
移動可能な航空機は空中退避などの選択がある。